La conservación de la fauna, ineludiblemente esta vinculada al estado del conocimiento que sobre ella se posea. En el estudio de sus poblaciones, a menudo es necesario evaluar características que no permanecen estables en el tiempo y que varían a lo largo de las diferentes épocas del año.
Aspectos como el ciclo reproductor de una especie, las fluctuaciones estacionales en su distribución, o las variaciones en la estructura poblacional, dependen de un factor importante que muchas veces condiciona los resultados en la mayoría de los estudios de fauna: el tiempo. Por ello, se hace necesario un seguimiento continuado, de manera que queden reflejadas las circunstancias que en mayor o menor medida acontecen en el área de estudio a lo largo de las diferentes estaciones.
 La base principal del Sistema de Seguimiento es un Cuaderno de Campo, que se ha mostrado como un instrumento eficaz y sencillo en la obtención de gran número de datos con poco esfuerzo.
El Cuaderno de Campo, diseñado por el Centro de Investigación y Gestión del Parque y manejado por los Agentes Forestales, vierte las observaciones de fauna a una base de datos, en la que se presenta información en tablas relacionadas, sobre todos los aspectos del seguimiento: especies, observadores, cuadrículas de muestreo, parámetros cualitativos y cuantitativos de las especies muestreadas, hábitat, etc. conectando dichos contenidos con un Sistema de Información Geográfica (S.I.G.) del que parte el análisis geográfico de los datos.
El Cuaderno de Campo se estructura básicamente en tres fichas:
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La Agenda de Campo está destinada a recopilar datos cualitativos que supondrán la información necesaria para evaluar atributos poblacionales tan importantes como la distribución y su evolución a lo largo del año, el sex-ratio, la organización social, los ciclos reproductivos, el aspecto externo y coloración, síntomas de enfermedades, etc. Todas las observaciones directas de fauna cinegética y catalogada son recopiladas en esta Agenda. Su característica fundamental es la continuidad, no suponiendo un esfuerzo extra en el trabajo habitual de los Agentes Forestales.
La Ficha de Censos complementa a la Agenda de Campo. A través de esta ficha, se recopilan datos de tipo cuantitativo, aportando información relativa a densidades y tamaños reales. La estima de densidades está basada en el método de itinerarios a través de un muestreo estratificado. En su planificación es necesario controlar tanto los factores del hábitat que intervienen en la distribución espacial de los individuos, visibilidad, agregación, etc, como los asociados con la especie, fenología, ciclo reproductivo, ritmo circadiano, etc. En la Comarca Parque Natural de Peñalara, unas 20.000 ha, cada Agente Forestal realiza 8 recorridos a pie, durante los meses de abril y octubre que oscilan entre 3 y 4 Km, muestreándose en torno a un 30% de toda la zona de estudio.
El método de itinerarios lineales consiste en registrar a los ejemplares detectados a lo largo del itinerario del observador que, a medida que avanza, anota la distancia a la que los animales son observados. Este método presupone que los animales son detectados en su posición natural (es decir, que no se han alejado o acercado a la línea de progresión), que el observador no se confunde al calcular las distancias y que los animales siempre son vistos si se encuentran en la misma la línea de progresión. A partir de esta información, se calcula la función de detección de la especie censada con la que, tras calcular el porcentaje de individuos no detectados, se realiza una estima de la densidad. Para el tratamiento de esta información se ha utilizado el programa Distance 5.0. (Research Unit for Wildlife Population Assessment, University of St. Andrews, UK).
 Las posibilidades de obtener información de animales abatidos a través de la caza o de los atropellados en accidentes de tráfico, son aprovechadas en esta ficha. Así, se obtienen inestimables datos sobre su morfología, fisiología, genética o cualquier otro aspecto de su biología que nos aporte información de interés para el conocimiento de la especie. Los Agentes Forestales, recopilan las medidas biométricas, el peso, el aspecto externo, la coloración, etc. También recogen muestras de incisivo y músculo estriado en el caso del corzo, con el objetivo de calcular la edad exacta a través de corte dentario y analizar la variabilidad genética. Los datos de morfología externa, permiten describir y caracterizar el aspecto de los animales, punto de partida en el análisis de la variabilidad tanto individual como en función de la edad, sexo y localización geográfica.
Como ejemplo, este sistema de seguimiento de fauna ha permitido obtener numerosos datos sobre la morfometría y diversidad genética del corzo.
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